层析柱主要是根据要分离的植物有效成份、化工中间体、化合物等物质与玻璃层析柱内的不同填料：

一、在不同的亲和度，

二、在不同浓度的酸碱液下，

 三、在不同的极性溶液下，

四、一定压力下在填料上不同的流速下有层次的分层